قالت "مؤسسة الاقصى للوقف والتراث" إن بلدية بئر السبع و(إسرائيليين) انتهكوا مساء أمس الاربعاء 5-9-2012 حرمة مسجد بئر السبع وقاموا باحتساء الخمور في ساحاته، وتعمدوا أن يفعلوا ذلك بجوار المسجد بما ترافق مع حركات ولباس فاضح ينتهك حرمته. وعدت المؤسسة في بيان لها اليوم الخميس 6/9/2012 تلك التصرفات نقضا من بلدية بئر السبع وبتواطؤ مع الشرطة (الإسرائيلية) لتعهداتها بعدم إدخال الخمور إلى ساحة المسجد، بناء على الاتفاق الذي حصل مع قيادة لجنة التوجيه العليا لعرب النقب. وأكدت المؤسسة أن ما فعلته البلدية يندرج في إطار سياسة الاضطهاد الديني والتمييز العنصري، وهو مواصلة لجرائم الاعتداء وانتهاك المقدسات الاسلامية والمسيحية في البلاد، ومن ضمنها تحويل مسجد بئر السبع إلى متحف تهويدي. وأكدت مؤسسة الاقصى من جديد أن مسجد بئر السبع مسجد إسلامي مقدس وهو حق خالص للمسلمين، وطالبت بارجاعه إلى أهله ومعاودة الصلاة فيه، مشيرة أن ساحته تأخذ صفة القداسة أيضا.