استنكرت رابطة الاسرى والمحررين ما تقوم به مصلحة السجون من وقت لآخر من الاعتداء على الاسرى الفلسطينين, سيما بعد توقيع الاتفاق الأخير بين الاسرى ومصلحة السجون الذي يقضي بتحسن معاملة الاسرى. وأدانت الرابطة الخميس 07-06-2012 الطريقة الوحشية التي قامت بها مصلحة السجون في سجن "بئر السبع" بالاعتداء على الأسير عبد الودود أبو سنينة، حيث انهالوا عليه بالضرب على كافة أنحاء جسمه بأيديهم وأرجلهم والقيود الحديدية، وسحبوه بالقوة إلى خارج الغرفة مما أدى إلى إصابته برضوض وجروح في مقدمة رأسه، وكذلك وجود انتفاخ بعينه بسبب اللكمات التي تعرض لها من قبل السجانين. وطالبت الرابطة بحماية الأسرى الفلسطينيين في كافة السجون من بطش الاحتلال وفرق القمع التابعة لإدارة مصلحة السجون، مشيره إلى أن ذلك يعد مخالفة واضحة للقوانين الدولية، ولبروتوكولات حقوق الإنسان. ودعت كافة وسائل الإعلام بتسليط الضوء على قضية الأسرى والممارسات القمعية والتصعيد الإسرائيلي بحقهم خاصة بعد توقيع الاتفاق بين قيادة الأسرى ومصلحة السجون.