حذّرت حركة المقاومة الإسلامية "حماس" من محاولات الاحتلال الإسرائيلي السيطرة على المسجد الأقصى من خلال الاقتحامات المتكررة، مرجعة ذلك إلى "تكبيل السلطة الفلسطينية ليد المقاومة وتماهيها للعودة إلى المفاوضات، والتقصير العربي والإسلامي؛ لنصرة القدس وإنقاذ المسجد الأقصى". وحمّل "فوزي برهوم"- الناطق باسم حركة حماس في تصريح صحافي وصل "فلسطين الآن" نسخة عنه الثلاثاء 2/10/2012م- حكومة الاحتلال الإسرائيلي المسئولية عن كل ما يترتب على هذا المخطط، داعياً كل الأطراف الفلسطينية والعربية والإسلامية لوضع إستراتيجية فاعلة لنصرة القدس والمسجد الأقصى، واستخدام كل أوراق الضغط على الاحتلال. وعدت الحركة اقتحام المتطرفين الإسرائيليين للمسجد الأقصى برئاسة المتطرف "موشي فجلين" وبحراسة جيش الاحتلال إمعان في الجريمة بحق المقدسات. ودعت الحركة كل أبناء الشعب الفلسطيني في القدس ومن يستطيع الوصول إلى المسجد الأقصى لدخوله والرباط فيه، مطالباً الجماهير الفلسطينية في كل فلسطين بالانتفاض وبكل قوة في وجه الاحتلال دفاعا عن القدس والمسجد القاصي، مضيفة: "هذا واجب ديني ووطني على الجميع". وفي سياق متصل، استنكر وزير الأوقاف والشئون الدينية " د. إسماعيل رضوان" اقتحام مجموعات يهودية مدعومة من شخصيات سياسية في (إسرائيل) للمسجد الأقصى لأداء شعائر "تلمودية" بمناسبة ما يسمى بعيد "العُرش" اليهودي. وقال رضوان:" إن الاعتداءات المتكررة على المسجد الأقصى واستباحته يعد استهتاراً كبيراً بمشاعر المسلمين, محذراً من تواصل مسلسل الاعتداءات على الأقصى. وطالب وزير الأوقاف المجتمع الدولي بالعمل على توفير حماية دولية للمسجد الأقصى الذي يتعرض بين الحين والآخر للاقتحام والتدنيس من قبل مجموعات عنصرية إسرائيلية بحماية من شرطة الاحتلال. ودعا رضوان المقدسيين إلى النفير العام في مدينة القدس الشريف ومحاولة الوصول للحرم القدسي بشتى الطرق للدفاع عنه, لافتاً إلى ضرورة فضح الممارسات البشعة التي يرتكبها الاحتلال بحق مدينة القدس والمسجد الأقصى.